間隔時間太短
疫苗并不是一接種就會立即刺激機體產生抗體，疫苗在貓咪體內發揮作用，使體內產生抗體是一個復雜的過程，這往往需要幾天到幾周的時間才能產生有效的抗體。如果在貓咪接種疫苗之前，因為一些原因已經處于疾病的潛伏期，或是主人平時不注意貓咪的護理，貓咪存在嚴重的寄生蟲感染時，接種疫苗后必然導致貓咪發病，從而導致免疫的失敗。所以在接種疫苗前，要對貓咪的狀況首先要有一個具體的了解，如果貓咪已經感染了一些疾病，那麼最好不要注射疫苗。
疫苗受到損壞
這是一些人為或是不可抗因素所導致的免疫失敗，往往是由于不適當的保存或運輸，比如運輸中碰倒了灑了或是保持不當，弱毒疫苗可能會失活從而發生免疫失敗。一般購入疫苗后都要盡快使用，對于數量較大，不能很快用完的應保存在低溫、陰暗、干燥的場所。在疫苗的運輸過程中溫度高于4℃，疫苗也會失效。
免疫程序不當
注射間隔太短，疫苗間會發生干擾現象，如果間隔太長，效果會降低。貓咪正確的免疫接種程序應該是從第9周開始注射第一針貓三聯，間隔3到4周加強一次，第一年基礎免疫注射2到3次貓三聯。幼貓同樣年滿3個月方可注射狂犬疫苗，第一年一次即可，以后每間隔11個月加強一次狂犬。
免疫缺陷
如果機體的免疫系統有缺陷，不能對疫苗產生正常的免疫反應，也會失敗。貓咪的先天性免疫缺陷主要是由貓咪免疫缺陷病毒引起的，貓咪的免疫缺陷的特征癥狀是口腔炎、牙齦炎和牙周炎，可能發生腹瀉或貧血，以及頑固的上呼吸道感染和不明原因的發燒。還有一些神經癥狀如行為變化、精神異常、癡呆、面部扭曲或抽搐。
